Poder se puede (hasta con un ratón, es cosa de Power Point no de la wacom). La pega es que los lápices capacitivos para la Transformer no son para nada precisos en comparación con la Bamboo (por experiencia). Si quieres hacer un circulo, señalar algo o poner letras grandes, entonces puede valer.
Tienes dos opciones:
a) Usar una aplicación que convierte la tablet en un ratón/touchpad del ordenador, bien por bluetooth bien por wifi. Hay varios, como
el gPad remote touchpad, simplemente busca remote touchpad, remote mouse o cosas así en el market. No he probado ninguno.
b) Usar una aplicación que permita controlar el PC remotamente haciendo mirroring, esto es, mostrando en la tablet lo mismo que en la pantalla. Así sabes dónde estás anotando realmente y no tienes ni que estar mirando la pantalla del PC (ideal para presentaciones). Imagino que el TeamViewer, el iDisplay o el ScreenSlide permitirán eso, igual incluso el Splashtop de Asus lo admite.
Esas son las ideas