Estoy teniendo los mismos problemas. Parece ser que android solo soporta los certificados en formato PEM-encoded x509. Y muchos certificados o no son con codificación x509 o llevan el formato DER. Intenta a instalar el certificado en un ordenador y luego exportarlo en formato PEM-encoded x509, luego lo cambias la extensión a *.p12 y lo copias al raíz de la sd. En el menú seguridad del android tienes una opción para importar el certificado.
Para los que podais usar una web antes, en este enlace podéis subir el certificado que querais instalar en android y os devolverá una URL para que la abráis con el navegador de android y os instale el certificado en el formato correcto.
http://www.realmb.com/droidCert
Espero que esto te sirva de ayuda.
Un saludo