Hola.
para instalar certificados raiz en formato .cer, .crt, .cert o .pem teneis que ir
desde un ordenador a esta web
http://www.realmb.com/droidCert en "Upload" seleccionar
el certificado de vuestro disco duro y clic en upload, os aparecera un enlace.
Ahora desde el movil abris con el navegador ese enlace y os aparecera un enlace que teneis que pulsar y ya os iniciara automaticamente el instalador de certificados os va a pedir una contraseña o si nunca instalasteis un certificado teneis que elegir una y cada vez que querais instalar un certificado teneis que volver a poner siempre esa contraseña.
Esta solucion creo que solo funciona a partir de 1.6 en adelante, yo la probe por primera vez en 2.1.
Para conseguir cualquier certificado raiz en windows [Tecla Windows]+R escribir certmgr.msc buscais el certificado que querais y clic derecho > Todas las tareas > Exportar
Saludos.