Yo pienso (es mi.opinion) que al flasear el cf-autoroot no te pone ningun custom recovery ... simplemente te roootea el terminal y se instala la apk superSU. Luego después se debe flasear tambien por Odin el recovery custom. Con lo cual si tu tienes el movil stock y flaseas el cf autoroot tendras el terminal stock, pero rooteado y con recovery custom.
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