mi recomendacion seria mejor rootearlo para siempre, no hay nada que temer. si crees que despues alguna app maliciosa podria hacer algo, primero debe pedirte permiso a ti para hacer algo. Cuando rooteas cada app que quiere usar privilegios de root pasa por ese filtro, y luego quedan en una lista de "apps conocidas" que pueden tener acceso a root.
con SuperOneClick es super sencillo rootear.