Vaya, lo que te recomiendo es lo siguiente:
1-Que hagas eso:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=340065
2-Que flashees con el wotanclient, la versión 58 de nuevo, hagas el root y intentes actualizar de nuevo, creo que los problemas que están causando ese tipo, son por el recovery, ya que al flashear el recovery CWM se borra el tan simple que tiene SE para instalar las actualizaciones.
Saludos!