No se donde has leido eso de que se instalan en una version muy distinta y que los expertos aconsejan no utilizarlo...yo nunca he tenido problemas para recuperar mis copias de seguridad subiendo a ginger o bajando a froyo.Normalmente las aplicaciones funcionan en estas 2 versiones y no deberia dar problemas con titanium backup.Otra cosa seria por ejemplo pasar de ginger a donut,eso si podria dar más problemas.