Prueba a reiniciar en recovery, haz wipe caché, haz wipe dalvik y reinicia, instaka SuperSU que nunca viene mal, si sigue igual tendrás que hacer restablecer de fabrica, matendras el root, no temas, pero deberás configurar todo de nuevo.
EDITO:
Prueba a desconectar Xposed,a veces provoca conflictos