Es curioso eso, la verdad no me vienen nada a la mente del motivo por el que ocurre.
Lo que sí puedes hacer es restaurar todos los ringtones originales. Descargarlos desde aquí:
Backup de Ringtones originales
Debes descomprimirla, ya sea en tu pc o directamente en el teléfono usando por ejemplo Root explorer, navegar como ROOT por el directorio /system/media/audio/ y reemplazar la carpeta ringtones.
Espero tus comentarios.
PD: ¿El backup que instalas cual es?, ¿El que tengo en la página o uno personal?, ¿El build.prop lo has modificado?