Intenta hacerlo directamente des de tu home. Ahora mismo no se que sistema de ficheros utiliza el disco usb que utilizas (puede que sea por eso que te da problemas).
Yo lo tengo todo des de mi home y sin problemas aparte que no son necesarios los privilegios de root para ejecutar el programa.
Para asegurarte de que no sea que se haya bajado algo mal de github, ejecuta los comandos de nuevo pero en la home (digo la home por comodidad).
salu2
EDIT: ahora he visto que era el sistema de ficheros (has respondido mientras escribía), me alegro de que ya este funcionando.