Vamos a ver, no todos los backup funcionan siempre al restaurarlos y te digo la razón, lo que pasa es que no se si es tu caso. Lo primero es que si tienes bootloader abierto y tienes la opción de cambiar el kernel, ese es uno de los problemas que te puedes encontrar a la hora de restaurar un backup porque no todas las rom soportan los mismos kernel y te podrían dar reinicios al restaurar, pero se solucionaría poniendole el mismo kernel que tenías cuando hiciste el backup.
Si ese no es tu caso y lo tienes bloqueado, no deberías tener ningún problema al restaurar el backup, yo siempre hago todos los wipes y formats antes de restaurar por si las moscas porque como te restaura todo tal como lo tenías te evitas tener algún problema