Esto es lo que he hecho por si quieres volver a intentarlo, a mi me ha salido bien en dos S2:
1- Copia de seguridad de todo lo que se quiere conservar.
2- Ejecutar Odin como Administrador y flashear la Rom JB de 4 archivos:
-en PIT poner el archivo:-----------emmc_EXT4_16GB.pit
-en PDA poner el archivo:-----------PDA.tar.md5
-en PHONE poner el archivo:---------PHONE.tar.md5
-en CSC poner el archivo:-----------CSC.tar.md5
-deben estar activadas las casillas Re-Partition, Auto Reboot y F. Reset Time
-iniciar telefono en modo download: Vol-, home y encendido y conectarlo al pc.
-pulsar Start y dejar que termine.
3- Se reinicia
4- Apagar e iniciar telefono en modo download: Vol-, home y encendido
5- Ejecutar Odin como Administrador y Flashear el Pit de 6 GB:
-en PIT poner el archivo:-----------I91001GB_6GB.pit
-deben estar activadas las casillas Re-Partition, Auto Reboot y F. Reset Time
-pulsar Start.
6- Se reinicia
7- Apagar e iniciar telefono en modo download: Vol-, home y encendido
8- Ejecutar Odin como Administrador y flashear kernel Apolo para rootear la Rom JB y quedar instalado tambien
el recovery ClockWorkMod.
-en PDA poner el archivo:-----------Apolo-4.15b_Light.tar
-debe estar desactivada la casilla Re-Partition y activadas Auto Reboot y F. Reset Time
-pulsar Start.
9- Se reinicia.
10- Copiar en la Sd Externa los zips de Cyanogen, Gapps pico y Recovery TWRP de isorec.
11- Apagar e iniciar en modo recovery: Vol+, home y encendido.
12- -En la pantalla de inicio de ColckWorkMod recovery hacer Wipe Data y wipe cache and Dalvik
-En Mounts and Storage format cache, format system, format data y format emmc.
13- instalar el zip de CyanogenMod
14- Instalar el zip de las Gapps pico
15- Instala el zip del Recovery TWRP de Isorec
16- Reiniciar
13- Tarda un buen rato en iniciar, si pasa mucho tiempo y entra en bootloop (a mi me ocurrió en los dos S2 que he hecho)
apagar, reiniciar en recovery TWRP y volver a instalar solamente el zip Cyanogen y reiniciar.
Y te dejo todo lo que he instalado.
Odin 1.85 (para descomprimir)
ROM de 4 archivos de Pirri_Mori (para descomprimir)
PIT de 3,4 y 6 GB (para descomprimir)
Kernels Apolo y Siyah con CWM (para descomprimir)
CyanogenMod 13 (sin descomprimir, se flashea el zip desde recovery)
Gapps pico (sin descomprimir, se flashea el zip desde recovery)
Recovery TWRP de Isorec (sin descomprimir, se flashea el zip desde recovery)