Selecciona la carpeta en donde quieres que se guarden antes de crear la nota. Otra alternativa es que a las notas que tienes ya creadas las puedes mover a la carpeta que prefieras usando cortar y pegar. No estoy seguro, pero creo que si mueves las notas de "Mis Documentos" tal vez no se sincronizen mediante Activsync, es cosa de que lo cheques.
Suerte
P.D. Se te han respondido recientemente un par de preguntas, pero no veo que hayas dado retroalimentación alguna sobre las sugerencias y los resultados que has obtenido, te invito a que lo hagas, un foro nunca podrá ser efectivo si no se entabla un diálogo entre los miembros de la comunidad.