Mira es muy simple, puedes ocupar un el archivo de un hotfix, descomprimes el zip y encontraras dos directorios (system y META-INF)
1. Entra al directorio system y borra todo su contenido
2. Crea el directorio de las apps (quedaría: system/app)
3. Agregas las aplicaciones dentro del directorio app
4. Creas el zip con los directorios principales "system y META-INF"
