La CM11 de Chrono me ha durado bastante la batería, en ese aspecto iba muy bien.
¿Has mirado en Ajustes/Rendimiento/Procesador? A ver si está fijado en modo alto rendimiento el Perfil y está todo el tiempo al máximo la CPU.
También puede que no haya entrado en deep sleep (instalar Wakelock detector).
O puede que esté descalibrada la batería al pasar de una rom a otra.
¿Qué CM12 estás usando ahora? ¿La de PolishVodka?