He visto las fotos de tu despiece. La parte de la CPU que tiene una chapa con manchas verdosas tiene mala pinta. Saca las dos chapas con cuidado para que no se doblen y límpialas y limpia los circuitos que están debajo, te recomiendo que utilices algún spray tipo CRC, no conduce la electricidad, desoxida y es hidrófobo (y barato).
Te dejo el link al post de Jarrish que nos dejó un manual de mantenimiento del Xperia S, en la página 73 tienes las chapas que te digo:
http://www.htcmania.com/showpost.php...30&postcount=3
EDITO: me acabo de leer tu post y ya veo que lo tienes solucionado: me alegro ;)