SI que se puede poner una actualizacion original con un recovery modificado, yo lo hago. Eso si con el signature check desactivado, porque no esta signado y por esto da error en los recoverys que verifican signatura, pero en el amon-ra 2.0 no hay problema.
Pero tal como dices, despues de actualizar pierdes el recovery modificado y tienes otra vez el original, asi que si no tienes el bootloader desbloqueado mejor no lo hagas y pones una rooteada.
salu2
