En la parte de las aplicaciones, las opciones que marques son las que no se instalan, o sea, lo que esté marcado es lo que se desinstala o mejor dicho se quita de la rom.
Si en la instalación has marcado lo del tiempo lo que ha ocurrido es que se ha desinstalado todo lo relativo al tiempo, al igual que con el polaris office y el resto de programas. Ese apartado de la instalación es para quitar programas.
Vuelve a instalar la rom encima haciendo Wipe Dalvik+Caché y en el menú de aplicaciones sólo deja marcadas las que quieras quitar. Luego tendrás que instalar de nuevo la actualización.
Me imagino que será eso lo que ha ocurrido.
Saludos.
