Si se te a borrado la agenda del movil es normal que en el whatsapp no te salga contactos cuando le das al lapiz, y tambien es normal que las conversaciones que hayas tenido solo te salga el numero de telefono. tendrias que poner otra vez de nuevo los contactos en la agenda o mira en las opciones a ver si por casualidad has desmarcado la casilla "telefono", para eso debes de ir a la agenda, luego darle a menu y luego opciones de visualizacion y mira que este marcada la casilla "telefono" o "SIM", depende de donde tengas guardado antes los contactos.
Me parece raro que se borren solos si no has echo un reseteo o algo.