Tienes la repartición de memorias hecha?
Lo que comentas de la SD es una característica de la ROM, inutiliza la SD INTERNA y hace creer al sistema que la SD EXTERNA es la interna.
Si no te gusta, instala el kernel " nosdcard", que lo mantiene como estaba originalmente.
En cuanto a no poder instalar la ROM, quizás tenga que ver con la repartición, si es que la tienes hecha. Si es así, igual no tienes suficiente espacio en la partición de sistema.