-Realizar copias de seguridad de las aplicaciones, para restaurarlas al cambiar de rom (Titanium backup)
-Realizar copias de la Rom entera (Rom manager)
-Acceder a las carpetas de sistema y modificar-borrar archivos, añadiendo o eliminando aplicaciones de fábrica que no interesan, que ocupan espacio, etc.
-Realizar copia de la carpeta EFS, en /system/, donde se encuentran todos los datos importantes del terminal (imei, etc.,), y que conviene tener a buen recaudo
-Instalar custom Roms, modificadas.
-Variar parámetros como velocidad de cpu, etc (esto ya para los que les guste trastear mucho)
-Y a nivel personal, yo uso la aplicación "button savior", que te permite poner los botones que tú quieras en cualquier parte de la pantalla táctil (atrás, menú, home, volumen +/-, screen off, etc)
Y más cosas que no me acuerdo ahora...