Es muy sencillito, yo solo seguí las instrucciones del propio programa.
NOTA: BAJAR EL Link2SD desde el propio Market (es gratuita)
1.- Rootear el teléfono con el método que mas os guste
2.- Con ubuntu y Gparted cambié el tamaño de la particion de la SD, dejando 512 megas libres al final, las formatee en FAT32, dejando la primera particion intacta.
3.- Reiniciar el telefono para que reconozca la nueva particion
4.- Entrar al programa, te pedira elegir tipo de particion, eliges Fat16/Fat32
5.- Reiniciar nuevamente el terminal
6.- Entrar a Link2SD y empezar a pasar aplicaciones a la SD...
Ademas cuando conectas el telefono al pc, la particion de las aplicaciones sigue montada en el telefono, por lo cual podemos seguir usando las aplicaciones
Edito: Lo de formatear la segunda particion en FAT32 en vez de en ext2/3, es porque segun indican en la documentacion del programa, los motorola "droid" no tienen soporte para este tipo de particiones y habria que instalarle un modulo al kernel, y como pasé de complicarme, y funciona bien con FAT32, pues así lo hice