El zip base siempre se puede usar con cualquier rom (pudiera dar error al inyectar iconos, pero no es lo normal). No reemplaza archivos de sistema. El 2º zip específico si reemplaza systemUI tematizado y por es debe coincidir con la versión. A veces, no cambia de unas versiones a otras y por eso se puede poner sin problemas. Pero en otras, si han cambiado algo, te encuentras con "Se ha detenido la aplicación IU sistema"
porque no es el apropiado de esa versión.