Con el recovery haces una copia exacta de lo que tengas en el movil hasta el momento anterior a al copia, como con los PCs y todos esos programas de backups que te hacen una copia exacta del windows , si tienes algun problema restauras la copia a fecha de cuando lo hiciste, hace copia de la Rom y de lo que contiene la particion EXT entre otras cosas , lo que tu pones no vale es otra cosa, hablamos de una copia total de los que tienes en el movil , una imagen exacta del movil hasta esa fecha, no de hacer copia de un puñado de aplicaciones.
A aparte hay una serie de programas que hacen copia de las aplicaciones y configuraciones del movil , para no tener que meter todo de nuevo cosa por cosa cada vez que cambias de Rom, como los que pones con el Go backup pero el que mas se utiliza es el titanium backup tienes en la guia de unrevoked un minitutorial de como se utiliza, conviene tener la aplicacion completa o porque lo has comprado, o porque lo has conseguido por google, HTcmania tiene una seccion de aplicaciones para android , seguro que estara alli
