Por las pruebas que hice, cuando el ID es el antiguo devuelve error de falta de inventario...
Eso me hace pensar que si los anuncionates han migrado al nuevo admob es normal que las apps con el ID antiguo configurado dejen de recibir anuncios. Sin embargo me extraña mucho xq el problema este no me pasaba en todas mis apps.
Lo que comentas, pues eso, quien no actualice seguirá sin recibir anuncios si el problema es el que comento. Si el problema fuera cualquier otro pues solo esperar a que admob lo resuelva