Probad añadiendo qemu.hw.mainkeys=1 en el build.prop.
Para usar los botones para mi lo más cómodo es LMT con el pie y con los botones en el lateral derecho (soy diestro).
Ahora que me he acostumbrado a LMT, la doble pulsación y las posibilidades que ofrece no Vuelvo a los botones ni loco.
Lo uso en el nexus 4 pero en el xperia es igual!