si colocaste el Mod para deshabilitar la "SD Interna" tienes que colocar una externa
y ahí colocar el archivo que quieres flashear.
en el CWMR tienes que seleccionar install zip from sdcard ----->choose zip from external sdcard ------>buscas la carpeta donde lo hayas colocado (el zip que pretendas flashear)
nota: la información que contenia tu sd interna estaba o esta en /data/media
saludos y suerte