Yo lo que haria seria pasar los datos de tu sd actual a la nueva de mayor capacidad (por si alguna app de las que tienes instaladas necesita esos datos, tipo juegos, copias del TB, etc).
Una vez copiados los datos, cambiaria una sd por la otra y deberia de funcionar, ya que creo que el script lo que hace es engaņar al sistema para que crea que la sd externa es la interna y viceversa. El script no afecta a la sd.
De todas formas espera a ver si lo confirma el forero lancelotpro y cualquier otro que lo sepa seguro ;)
