Son muy diferentes, vnc es para el control total del ordenador con el propio entorno gráfico del servidor y gmote se utiliza como control remoto (reproductor de música, movimiento del raton, entrada de texto), aunque gmote tiene una segunda cara que está en fase beta, aunque funciona muy bien, y es la de reproducir música e imagenes del ordenador en el teléfono móvil.
Os animo a que probeis
Andremote, es un soft muy potente debido a lo flexible que puede llegar a ser, ya que es el propio usuario el que puede crear su propio control remoto a medida. A los diferentes tipos de controles se les llama layout y por defecto vienen unos cuantos para instalarlos, algunos simplmente curiosos y otros útiles y necesarios, como puede ser el del reproductor de música, vídeo, powerpoint, shake mouse...
Este último es útil y gracioso, ya que agitando el móvil o pulsando sobre la pantalla, el puntero del ratón se situará en la esquiana superior derecha. Se puede utilizar para ocultar el puntero cuando estás viendo una película en pantalla completa o simplemente para gastarle una broma a alguien, ya que en esa esquina se encuentra el cuadro de cerrar ventana xd
En fin, que puedes incluso hasta crear tu propio control remoto para subir/bajar el brillo, avanzar/retroceder el audio de las películas, etc, etc.
La única pega es el control de desplazamiendo del puntero del raton, que no funciona fluido, probadlo y lo comentais.
PD: También está el PhoneMyPC, es tipo VNC pero con menús adiccionales como accesos directos a capturas de pantalla, procesos activos, puedes minimizar ventanas, ocultarlas...