Las aplicaciones del sistema (algunas) las puedes al menos inhabilitar, te desaparecen del cajon de apps, y no consumen ram (creo)
Yo es lo que he echo. Ya que si luego restableces de fabrica de nuevo y las has borrado, esas aplicaciones no las tienes. Por tanto de momento mejor no tocar (ademas tenemos espacio de sobre, sino me las hubiese cargado)
Siendo root, puedes logicamente desisnstalar esas aplicaciones, y tener acceso total a la tablet. (archivos del sistema). Tambien ejecutar aplicaciones que requieran ser root. Yo por ejemplo, he instalado una app para usar el sixaxis de la play 3. Para esa aplicacion tienes que ser root por ejemplo.
Y asi sucesivamnete.
Lo del modo debug/ desarrollador, esta en opciones de desarrollo, depuracion usb y activas esa pestaņa creo.