Imagino que sustituir el que tuvieras o poner el boot.img, cosa que quizás no haga el update.app (puede que el teléfono no arranque si no lo haces tu después), otra cosa es como lo pongas, supongo que las instrucciones de la ROM no las tendrás a mano.
Se podría hacer desde el recovery CWM (si está disponible), metiendo el archivo en un zip e instalarlo desde allí.
Saludos.