Las apps se guardan una parte en el celular y la otra en la memoria SD, por lo cual cualquier cosa que se instale te va a pedir que tengas instalada la memoria.
No es posible estar manejando varias memorias a la vez en el celular, ya que generara conflictos en el celular.
Debes de apagar el celular e ingresarle la memoria con que hiciste el root, prender el celular y ver que inicio te da, si no puedes ver nada. La unica alternativa es flashear el celular(poner una rom).