A mi me pasaba lo mismo, pero el problema no es el root, sino la aplicación. En esta entrada:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=422375
recomiendan que en esos casos, en vez del SuperUser mejor se instale el SuperSU, así lo hice y me funcionó perfecto, a la primera y sin ningún problema:
https://play.google.com/store/apps/d...xLDEsImV1LmNoY WluZmlyZS5zdXBlcnN1Il0.
Muchas gracias por la aclaración.
Para la tarea de eliminar apps encontré una fabulosa herramienta llamada System Cleanup que las elimina del sistema fácilmente:
https://play.google.com/store/apps/d...dGVrcy5vcmciXQ..
Muy recomendable