He estado mirando lo de la rotación, a ver si se podía conseguir a través de un tweak de build.prop pero parece que hace falta que el kernel esté preparado para poder hacerlo.
Lo del botón de aplicaciones en la parte superior... eso depende del launcher que uses, hay algunos que lo tienen en otro sitio o que te dejan ponerlo donde quieras, pero claro, si cambias de launcher perderás los widgets del Sense, que sólo funcionan con Rosie (el launcher original del Sense).
Si quieres probar diferentes launchers te recomiendo un programita llamado Home Control, sirve para poder cambiar de launcher de forma cómoda y sencilla y lo tienes gratis en la Play Store. El VTL launcher permite que pongas el botón de aplicaciones donde quieras, por ejemplo, es el más configurable de todos los que he visto. También funcionan bien el Go Launcher EX y el Go Launcher HD (el HD es el que yo uso, especial para tablets) y el Holo launcher también tiene muchos seguidores... si te apetece probar launchers ahí tienes unas cuantas opciones
Para el tema del root... no es tan complicado como parece, en serio. Tienes un manual en la sección de ROMs y desarrollo que escribí sobre el tema y que explica todos los pasos uno por uno, sólo hay que seguir los pasos. Al principio parece mucho y asusta, pero si te pones al lío verás que es mucho menos complicado de lo que parece.
