Y antes de dar a plugins haces esto??
Bien lo instalas enciendes el movil y activas lo siguiente
Ajustes/seguridad/Fuentes desconocidas
Ajustes/opciones del desarrollador/Depuracion USB
Ajustes/Xperia/conectividad/Modo de conexion USB/ MSC
abres Flashtool y esperas a que te lo reconosca
cuando te lo reconosca le das click en Plugins/bootloaderUnlock/Run
Ed: a mi con la o.6.9.1 si me da la opcion despues de hacer esos ajustes
