y por lo que dices sique te entra automaticamente en el custom recovery,la opcion reboot system now es para iniciar el telefono.
y toda esa lista que te sale cuando lo reinicias
reboot system now
apply update from sdcar
wipe data
....
power off
todo eso son las opcines del recovery
de todas formas yo intale la segunda opcion del tuto y para entrar al recovery lo haces desde la misma aplicacion que instalas,en vez de hacerlo automaticamente como te pasa a ti.
salu2