yo personalmente lo que hice fue lo que comentas, copie todo el contenido de la sd a mi disco duro y una vez hechas las particiones, lo restaqure en la particion de fat32... y listo
Si una vez realizadas las particiones quieres volver a tu rom antigua, no hay ningun proble, lo haces y punto, la tarjeta seguira particionada aunque la rom no lo requiera, y esta bien asi, porque asi lo tienes hecho ya para futuros cambios de roms
saludos!