Cuando ejecutes el Titanium Backup, vas a Copiar/Restaurar, y las aplicaciones que quieras detener pulsas una vez sobre ella, se te abre un menú y le das a congelar, hasta que reinicies el teléfono o la vuelvas a activar manualmente estará detenida y no comerá ningún recurso ya que estará desactivada, hasta que quieras o reinicies.
Saludos.