Un format-system NO borra los datos ni las aplicaciones del teléfono. Tan solo "refresca" la partición del sistema dejando una partición limpia, sin aplicaciones de sistema no utilizadas de la anterior. Es tan "inocuo" como un wipe-dalvik-cache.
NOTA:
Por ahora, utilizar la 20120322. Hay un problema con el cambio
Allow theming of framework UI elements y prefiero esperar a que esté solucionado para que vaya con él, ya que es un cambio interesante.