Se me ocurren un par de cosas, una por ejemplo es usar algun widget para activar manualmente el montaje de SD por usb, por ejemplo widgetsoid tiene un widget para eso, lo tienes gratis en el market.
Otra opcion, que quiza ya hayas probado,, para descartar que sea tema de configuracion, haz un wipe data / factory reset. Si despues de eso sigue fallando podria ser cosa del cable usb que no este bien.