Pierdes y no pierdes parte de la memoria, depende como lo mires.
Lo que consigues con eso es que la partición de menor capacidad se use para instalar aplicaciones y juegos, y la partición mayor se use para guardar tus cosas, como: video, fotos, musica...
Así que depende como lo mires, pierdes memoria para guardar archivos multimedia (musica, videos...) pero ganas memoria para instalar las aplicaciones y juegos.