A ver si de una vez lo aclaramos. Con el nuevo hboot 2.00.0002 si se desbloquea por el método oficial pasa a estar "UNLOCKED" pero continuamos en S-ON y se puede poner "RELOCKED" en cualquier momento. Pues bien, estando asi ya es posible instalar un recovery y por ende cualquier ROM (la MUIU a mi no me ha funcionado) pero todas las que he probado con sense si, incluso es posible rotear la oficial.
En cuanto a la garantía, yo creo que no se pierde, pero hasta que alguien no la lleve al SAT estando así, no lo sabremos.