Te funcionará todo igual, simplemente tardará mas en generar la dalvik caché, ya que no hay codigo precompilado. Cerberus funcionará, podrías tener en /system aplicaciones odex y deodex y todas funcionarían (si calificasemos a cerberus -la que pones en /system/app-, al ser solo un .apk, sería una app deodex)y el resto de apilcaciones no se ven afectadas para nada.