Pongo cómo he instalado twrp y magisk después de actualizar a MIUI9 sin tener que volver a instalar la rom:
1. Apago el móvil y lo pongo en modo fasboot enchufándolo al pc y encendiendo mientras pulso vol-
2. Escribo los comandos:
fastboot devices
fastboot flash recovery twrp.img (no se si era necesario)
fastboot boot twrp.img
3. A continuación reinicia en recovery twrp, selecciono instalar imagen en lugar de zip y flasheo twrp.img en recovery.
4. Flasheo zip del magisk, wipe davilk y caché, que para eso viene el botón al lado de reiniciar.