Yo creo que el problema no es el que comentas. A pesar de tener muchas cosas y de estar modificado por fabricantes, Android es muy estable en general y tampoco se puede decir que esté repleto de fallos. Es más, el módulo de Calendar Storage que es el que falla, lleva casi inalterado desde que Android apareció, porque su funcionalidad es muy básica. El problema es que en Marshmallow introdujeron lo del doze, eso les obligó a cambiar la estrategia del módulo del calendario, y con las prisas no lo probaron bien y quedó mal. Si usas una aplicación que no use calendario puedes estar tranquilo, no interactuará con el módulo erróneo y tus alarmas funcionarán.