Yo soy usuario de siempre de AMOLED, de hecho es requisito 100% indispensable en mis teléfonos (He tenido HTC Desire, Moto X, Nexus 6 y ahora el 6P que me llega en breves) y nunca he visto ese parpadeo, no sé a qué te refieres.
Te pasa con alguna aplicación específica? Igual es problema de software...
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