Yo recupere apps con titanium.
El tema esta que cuando haces el cambio de sistema de archivos de data también vacía el espacio interno (fotos, descargas, etc) por eso has de copiar todo al pc.
De este modo deberías poder hacer backup de data con twrp, sacar la copia al pc junto con fotos y esas cosas, formatear en f2fs y recuperar el backup.
Enviado desde mi Mi-4c mediante Tapatalk