Es que criskelo hace muchos cambios en el framework y si le metes un framework "normal" por decirlo de alguna manera te petará por un sitio u otro, lo ideal para meter un tema es pillar los archivos de esa rom y meterle las modificaciones que normalmente son las imagenes, y algun XML, pero salvo que cambien mucho los colores incluso solo las imagenes.
Yo lo que hago cuando cambio de rom es eso, pillar los archivos de imagen que quiero cambiar y modificar sobre los archivos de la rom, te evitarás problemas y tendras la rom como la ha "parido" su creador con sus modificaciones, tweaks, etc..., es que el framework es lo principal de una rom y es el que tiene mas modificaciones, los 5 lockscreens, el menu extendido, las animaciones, etc...