Primero gracias por el curro que te estás pegando porque es bestial

Te he respondido en otro post pero lo pongo aquí también por si alguien tiene el mismo problema

Os cuento por si os pasa con todos los pasos:

1º Te haces root
2º Eliminas las aplicaciones que no quieres
3º Haces un Hard Reset desde el móvil (Ajustes -> Privacidad -> Restablecer datos de fábrica)

Cuando ya tienes el móvil como Vodafone te lo entrega, sigues siendo root, pero en la lista de aplicaciones hay dos iconos en blanco, que si los pulsas te dice aplicación no encontrada. No se que aplicaciones son pero salen. Las aplicaciones que has borrado después de hacer root no aparecen, es como sí el Xperia no llevara una imagen internamente para hacer el Hard Reset. En mi otro móvil, la Desire, podias borrar aplicaciones pero cuando hacias un Hard Reset estaban ahí de nuevo.

Solucionado: Después de configurar el télefono, si lo reinicias esos dos iconos desaparecen