Yo uso el de Amon-RA y la verdad es que no me ha dado ningún problema. Supongo que si instalo el clockworkmod recovery mi copia de seguridad nandroid hecha con el de Amon-RA ya no será válida, no?.
Una duda que me surge es qué limitaciones tienen los distintos recoverys con respecto a la versión de android y a las gapps.